科学平台已建立了以结构与功能分析技术实验室、生物成像中心、蛋白质组学技术实验室和实验动物中心4个专业技术实验室为核心，以仪器创新研制和技术服务中心为特色，以5个开放实验室为辅助，以医学免疫诊断研究中心和中科健兰集团为产业转化的生命科学研究技术装备体系。

结构与功能分析技术实验室主要以蛋白质晶体衍射结构解析和核磁谱仪分析技术为主要技术能力，完整涵盖了从蛋白质制备到蛋白质功能分析的技术条件保障。

生物成像中心致力于实现对生物学对象从纳观尺度到介观尺度的高分辨率三维成像，通过对生物超微高分辨率三维结构的研究来回答生命科学的关键问题。目前，该中心集成了超分辨率光学显微技术、低温电子显微技术、三维重构技术、低温扫描微加工技术、单分子荧光成像技术、原子力显微技术、光电关联显微成像技术以及一系列生物显微成像样品技术，承担了北京及周边地区生物显微成像技术服务工作，极大促进了相关生命科学前沿研究的进展，成为我国生命科学基础研究的重要支撑平台。

蛋白质组学技术实验室以分析测试中心为运行模式。实验室全面开展了基于色谱、电泳、质谱和稳定同位素标记技术的蛋白质组学和代谢组学新技术、新方法研究与应用，为所内所外承担的重大科研课题提供技术支撑服务或开展合作研究。

实验动物中心是研究所科研工作重要的科研设施。中心以动物实验为主旨，为研究所课题组提供SPF级别实验动物饲养与动物实验技术服务。同时开展病理分析以及与实验动物相关的实验技术和实验方法创新研究。仪器创新研制和技术服务中心承担了研究所创新仪器研制工作，同时为研究所和周边科研单位提供了仪器维修服务。

医学免疫诊断研究中心是科学研究平台抗体药物和体外诊断的技术合作与成果转化基地，也是中科院生物物理所的医学免疫诊断样本库，目前拥有抗体工厂、检测平台、诊断试剂三大技术支撑，提供抗体定制、免疫学检测以及体外诊断试剂研发、注册报批、生产转化等一系列服务。

中科健兰集团是在中国科学院和北京市怀柔科学城重大专项支持下，创立的国际医学科学转化平台。依托国家蛋白质科学中心，承担着大量的医学转化项目，建立了以疾病新靶标为核心的体外诊断系统，研制了重大疾病免疫进化治疗新模式，创建了京津冀和长三角及淮海经济区三大生物医药产业基地，是集产学研用为一体的新型转化医学研究机构。

科学平台拥有中国民族卫生协会、国际院士联合体、美中国际商会和九三学社中央委员会医药卫生专门委员会等行业资源，拥有抗体药物、体外诊断试剂和创新检测技术等项目集群资源，拥有中国科学院、英国医学研究理事会技术局、日本国立癌症研究中心和综合性三甲医院的科学家和临床专家资源。代表性项目有：体外诊断试剂，医学检测技术，抗体原料工厂，膀胱癌三位一体诊疗体系，癌症新靶标早期预警系统，新冠肺炎创新诊疗方案，男性新两癌筛查技术，STL干细胞唤醒液，高端医学健康检验，先端免疫进化治疗技术。